দেশের ২৩টি স্থলবন্দরের মধ্যে সচল রয়েছে ১১টি বন্দও এর মধ্যে সবচেয়ে বড় ও বেশি রাজস্ব আদায় হয় বেনাপোল স্থলবন্দরে। কিন্তু ভারতের পেট্রাপোল বন্দরের বিভিন্ন জটিলতায় চরমভাবে ব্যাহত হচ্ছে দুই দেশের আমদানি-রফতানি বাণিজ্য। আগে পেট্রাপোল বন্দরে আমদানি-রফতানির আনুষ্ঠানিকতা হাতে কলমে করা হতো। বর্তমানে বন্দর অটোমেশন প্রক্রিয়ায় আসায় এ কাজ করা হচ্ছে অনলাইনে। কিন্তু তাদের উন্নতমানের পর্যাপ্ত যন্ত্রপাতি নেই। প্রায়ই পেট্রাপোল বন্দরে প্রিন্টার ও ইন্টারনেট সার্ভারে সমস্যা দেখা দেয় ফলে বন্ধ হয়ে পড়ে আমদানি-রফতানি বাণিজ্য।